Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms