Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms