Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms