Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Garnl3Q3V0G7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms