Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms