Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms