Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5aQ3UXZ9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.27■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms