Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chpf2Q3UU43 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms