Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms