Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Acsf3Q3URE1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms