Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Elf3Q3UPW2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Elf3Q3UPW2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Elf3Q3UPW2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Elf3Q3UPW2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Elf3Q3UPW2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Elf3Q3UPW2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Elf3Q3UPW2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Elf3Q3UPW2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Elf3Q3UPW2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Elf3Q3UPW2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Elf3Q3UPW2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Elf3Q3UPW2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Elf3Q3UPW2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Elf3Q3UPW2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms