Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep63Q3UPP8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cep63Q3UPP8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms