Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc4Q3UP24 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc4Q3UP24 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc4Q3UP24 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc4Q3UP24 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrc4Q3UP24 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms