Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms