Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms