Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms