Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms