Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf224Q3UIW8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf224Q3UIW8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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