Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms