Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed8Q3UHI4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms