Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms