Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc174Q3U155 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms