Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms