Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InipQ3TXT3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
InipQ3TXT3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms