Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21440Q3TTD8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms