Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CiartQ3TQ03 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms