Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms