Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem248Q3TBN1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem248Q3TBN1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms