Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccbe1Q3MI99 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms