Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms