Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim71Q1PSW8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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