Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sap25Q1EHW4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sap25Q1EHW4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms