Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptcd3Q14C51 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptcd3Q14C51 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms