Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ptchd1Q14B62 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms