Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam83bQ0VBM2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam83bQ0VBM2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms