Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Neurl1bQ0MW30 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Neurl1bQ0MW30 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms