Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn2bQ0KL01 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms