Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms