Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms