Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MestQ07646 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MestQ07646 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MestQ07646 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MestQ07646 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MestQ07646 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MestQ07646 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MestQ07646 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MestQ07646 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MestQ07646 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MestQ07646 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MestQ07646 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MestQ07646 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MestQ07646 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MestQ07646 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MestQ07646 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MestQ07646 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MestQ07646 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MestQ07646 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MestQ07646 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MestQ07646 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MestQ07646 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MestQ07646 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MestQ07646 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MestQ07646 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MestQ07646 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MestQ07646 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MestQ07646 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MestQ07646 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MestQ07646 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MestQ07646 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MestQ07646 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms