Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a2Q07643 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms