Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms