Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPINDOCQ05AH6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms