Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx1Q04742 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx1Q04742 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms