Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnb1Q03717 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms