Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlh1Q02576 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms