Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnnb1Q02248 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms