Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcqQ02111 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms