Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms