Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms